Основные задачи таможенной службы решаются по определенным принципам, которые обеспечивают сведение к минимуму любых рисков.

В основе построения системы таможенного менеджмента лежат следующие принципы:

- четкая целевая направленность (все таможенные службы и посты подчиняются таможенному законодательству);

- функциональное единство: все таможенные службы находятся в тесном взаимодействии, для всей этой системы разрабатывается функциональная подсистема управления рисками;

- информационное единство: возможность единого информационного подхода к организациям, участвующим в таможенном регулировании;

- все меры, предпринимаемые для снижения рисков и предотвращения рисковых ситуаций, разрабатываются в соответствии с законодательной системой;

- использование одного принципа по отношению к принятию управленческих решений, направленных на минимизацию рисков.